MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 8354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017308	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017308	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017308	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017308	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017308	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017308	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017308	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017308	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017308	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017308	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017308	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017308	TA	4	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017308	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017308	ACG	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017308	TTC	2	6	8262	8267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017308	T	6	6	8284	8289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017308	TTA	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017308	GAAA	2	8	8467	8474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017308	CTG	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017308	TGT	2	6	8589	8594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017308	CTG	2	6	8597	8602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017308	TGC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017308	GTC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017308	TGC	2	6	12018	12023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017308	GTT	2	6	12088	12093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017308	AAC	2	6	12248	12253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017308	AGG	2	6	12294	12299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017308	TGT	2	6	12363	12368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017308	GAA	2	6	13207	13212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017308	GTT	2	6	13227	13232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017308	T	7	7	13250	13256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017308	GT	3	6	13316	13321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017308	GGT	2	6	13348	13353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017308	T	6	6	13365	13370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017308	GAC	2	6	13449	13454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017308	TTATC	2	10	14073	14082	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017308	AGG	2	6	14315	14320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017308	CAGTA	2	10	14615	14624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017308	GCG	2	6	14696	14701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017308	CGT	2	6	14722	14727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017308	GGC	2	6	14750	14755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017308	CTC	2	6	14764	14769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017308	AGA	2	6	14881	14886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017308	AGA	2	6	14895	14900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017308	AATC	2	8	14942	14949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017308	AAAG	2	8	15034	15041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017308	GCA	2	6	15047	15052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017308	GAA	2	6	15128	15133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017308	CT	3	6	15189	15194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017308	AAG	2	6	15225	15230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017308	AGCT	2	8	15333	15340	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017308	TAG	2	6	15372	15377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017308	A	6	6	15402	15407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017308	CAGTG	2	10	15479	15488	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017308	TTG	2	6	15605	15610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017308	CCA	2	6	15614	15619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017308	AAGG	2	8	15646	15653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017308	A	6	6	17543	17548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017308	TAGCG	2	10	18307	18316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017308	GCA	2	6	19751	19756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017308	GAA	2	6	20078	20083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017308	GAAA	2	8	20203	20210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017308	TGG	2	6	20259	20264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017308	GCT	2	6	20345	20350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017308	CGA	2	6	20384	20389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017308	A	6	6	20605	20610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017308	AGT	2	6	20886	20891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017308	GAA	2	6	20914	20919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017308	TCCC	2	8	20936	20943	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_017308	CCT	2	6	20947	20952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017308	GCC	2	6	20973	20978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017308	GTC	2	6	20979	20984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017308	GAG	2	6	21056	21061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017308	GAT	2	6	21172	21177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017308	CGG	2	6	21213	21218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017308	AGCTTC	2	12	21323	21334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017308	CACAC	2	10	21425	21434	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_017308	CGA	2	6	21444	21449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017308	ACA	2	6	21506	21511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017308	ATC	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017308	GAT	2	6	21748	21753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017308	TC	3	6	22233	22238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017308	TAT	2	6	22264	22269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017308	AGC	2	6	23342	23347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017308	T	6	6	23393	23398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017308	TCAT	2	8	23449	23456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017308	TGAT	2	8	23467	23474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017308	CT	3	6	23508	23513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017308	AT	3	6	23569	23574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017308	TTG	2	6	23709	23714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017308	GCTA	2	8	28754	28761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017308	TAT	2	6	28779	28784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017308	TA	3	6	29139	29144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017308	CT	3	6	35592	35597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017308	GA	3	6	35617	35622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017308	CTCCTG	2	12	35658	35669	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017308	AGC	2	6	35673	35678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017308	CTT	2	6	35730	35735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017308	CTC	2	6	35736	35741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017308	GCA	2	6	35777	35782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017308	CTG	2	6	35796	35801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017308	TGC	2	6	35806	35811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017308	CGT	2	6	35816	35821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017308	GA	3	6	35926	35931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017308	CAGG	2	8	35946	35953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017308	CGC	2	6	36002	36007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017308	CTT	2	6	36035	36040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017308	TAA	2	6	36058	36063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017308	CCA	2	6	36087	36092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017308	GCA	2	6	36109	36114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017308	AAG	2	6	36120	36125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017308	TGA	2	6	36128	36133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017308	GCCC	2	8	36135	36142	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_017308	TCT	2	6	36164	36169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017308	G	6	6	36180	36185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017308	GT	3	6	36226	36231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017308	CG	3	6	36236	36241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017308	TGGC	2	8	36255	36262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017308	GCC	2	6	36265	36270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017308	CTG	2	6	36341	36346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017308	GTC	2	6	36367	36372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017308	CCA	2	6	36422	36427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017308	CGG	2	6	36465	36470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017308	AG	3	6	36520	36525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017308	GGC	2	6	36594	36599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017308	CTA	2	6	36672	36677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017308	GTG	2	6	36803	36808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017308	TGG	2	6	36819	36824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017308	CGT	2	6	36864	36869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017308	AGC	2	6	36884	36889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017308	GTC	2	6	36904	36909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017308	ATC	2	6	36941	36946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017308	TGAGG	2	10	37002	37011	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017308	GAG	2	6	37569	37574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017308	CCT	2	6	38609	38614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017308	TACT	2	8	38635	38642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017308	GCA	2	6	38671	38676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017308	TAG	2	6	38711	38716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017308	AAGA	2	8	38717	38724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017308	ATT	2	6	38930	38935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017308	CAC	2	6	38940	38945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017308	C	7	7	39019	39025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_017308	T	6	6	39097	39102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017308	TGCG	2	8	39167	39174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017308	CACAT	2	10	39186	39195	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017308	C	6	6	39217	39222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
147	NC_017308	TGT	2	6	39969	39974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_017308	ATA	2	6	40965	40970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017308	TA	3	6	40969	40974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017308	GCTG	2	8	41028	41035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017308	TGA	2	6	41098	41103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017308	GTA	2	6	41757	41762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017308	TCGG	2	8	41981	41988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_017308	GC	3	6	42321	42326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017308	CCG	2	6	42388	42393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_017308	TGG	2	6	42423	42428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017308	ACC	2	6	42700	42705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_017308	GCG	2	6	43176	43181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_017308	GTG	2	6	43698	43703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_017308	GAT	2	6	65347	65352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_017308	GCG	2	6	114174	114179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_017308	CTT	2	6	114191	114196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_017308	ATG	2	6	114264	114269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017308	TACC	2	8	115190	115197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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426	NC_017308	GGCA	2	8	115227	115234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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428	NC_017308	GTT	2	6	115267	115272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017308	GTG	2	6	115282	115287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017308	GTG	2	6	117327	117332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017308	AAC	2	6	118974	118979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_017308	CAT	2	6	119267	119272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_017308	TCT	2	6	119500	119505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_017308	GTG	2	6	119512	119517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
460	NC_017308	TGG	2	6	119596	119601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017308	GGC	2	6	119622	119627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_017308	TTG	2	6	119659	119664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017308	TCG	2	6	119768	119773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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